根据女娲智能系统的计算，它制定了一个殖民计划安排，首先它需要重新修补盘古号，盘古号由于坠毁撞击，遭受了重大破损，为了从地底爬出来，女娲只是操作飞舟机器人简单的修补了一下，这才变成了如今的蚯蚓模样，但盘古号的能量驱动核心在坠落中遭到破坏，无法作宇宙飞行了，大修一番，最多只能恢复低空飞行功能。

其次它准备修补地球大气层，经过了千百多年的时间，地球自身已经使得那个大气层空洞缩小了不少，但还有五公里方圆，这里说的大气层空洞自然不是说一个联通宇宙的空气洞，而是一处无法抵御宇宙射线的稀薄大气层。

第三，它将通过殖民星系的克隆技术，制造出强大的克隆战士，剿杀地球中的那些变异生物，从而制造一个安全的殖民环境。

之后，前面两个工作花了近三千年的时间才真正完成，仅仅盘古号修复工作就花了一千多年，地球上到处是变异的生物，女娲智能系统很难取得合适的矿物来修补盘古号，为此盘古号不得不以本体面对各类变异生物，这一经历，可以说是充满的危险性，最终恢复了盘古号的大部分功能，并可以在地球内悬浮飞行。

之后，通过两千多年的努力，才又通过矿物燃烧方法修补大气层，终于使得地球的大气层空洞完全恢复。

在这期间，女娲智能系统根据盘古号和地球变异生物战斗后获得的变异生物的基因资料，开始了它第三步克隆战士的制造计划。

在盘古号宇宙飞舟中原本存储有许多专门制造高等克隆战士的外星克隆原液，这种克隆原液培养出来的克隆战士，可以完美的融合各种克隆基因，通过这种外星克隆原液制造出来的克隆战士，被女娲智能系统称为巫战士。

然而由于当初宇宙飞舟的毁损，这些克隆原液也泄漏了绝大部分，女娲智能系统使用盘古号飞舟中残存的克隆原液，只制造出了十二个祖巫，这些祖巫的基因融合了地球上各种变异生物的优质基因，身体素质以及力量甚至可以比拟地球上那些变异的神兽，几个祖巫联合，就是神兽也不是他们的对手。

然而，女娲还是错误的估计了地球上这些变异生物的实力，毕竟智能系统无法考虑到意外的变化，三千年的时间，地球上原生土著变异生物也产生了进化。

地球上的变异生物中出现了智能，特别是那些神兽级别的生物，它们已经不在是只有生存本能的动物，而变成了“妖”兽，所谓的“妖”，就是变异，不同一般，懂得思考的。

这些妖兽的本领比原本的普通变异生物更为强大，它们炼就了内丹，可以变化成半兽半人的战斗形象，它们通过内丹感应到天地自然的能量，借用这些能量，战斗起来即便是十二祖巫也不能轻易战胜。