一百万多万两白银看似数目巨大，但对海军建设其实并不多。廖泥鳅之前提出了要将海军扩充为二万人，大小火炮战船要达到两百艘，但一算成本帐却焉了头。实际上不管购买还是自建，战船本身并不贵，中型战船不过数千两银子，大型战船也不过值万余两，最大型的三重楼船也不会超出五万两白银。真正昂贵的是战船上的火炮。就拿一艘装备二十门炮的中型战船来说，一门炮便需要铜料三百斤价值三十两白银，制造成本是铜料三倍左右，故一门炮加上必要的弹药便一百五十两白银，二十门炮便是三千两，再加上船体造价两千两，一艘中型火炮战船便要五千两白银。由于大型战船的所用的火炮更大数量也更多，故造价更是中型火炮战船的三至四倍。实际上，这还是因为流求岛上有丰富的铜矿，也不缺优质木材和铁，如果材料外购，成本还会翻上几倍。

反复核算之后，流求公司决定成立一支主力舰队和二支分舰队，分别驻守在台北、台南和小流求。主力舰队有十艘大型战舰、二十艘中型战舰和四十艘小型战舰，分舰队战船数量减半。按大型战舰一万五千两白银一艘，二十艘计三十万白银；中型战舰五千两一艘，六十艘计三十万白银；小型战舰二千两一艘，一百二十艘计二十四万白银，仅主力战船便要花费八十四万两。如果再加上火战船、侦察船、爆破船、运输船等船只，这一百多万两白银不仅不算多，反倒显得略有不足。在人数方面，每艘大型战舰一百五十人，中型战舰八十人，小型战舰三十人，总兵力达到了一万零二百人，如果加上辅助船只的水手人数，兵力达一万二千人。

当下流求海军实力仅堪堪达到上述规模的四分之一，虽然有了资金保障，但要建设一支上万人的海军绝非易事，仍需要较长时间才能实现。海军舰队建设需要“船只、船员、火炮”这三大要件。与川西霹雳军扩军中主要缺火炮不同，流求海军当下最缺的并不是火炮，而是战船和有经验的水手。余柱从川西带来的技术人员早就掌握了铜炮制造技术，流求的铜矿开采出来之后，他们又根据本地铜料的情况进行了配比调整和生产工艺优化。由于铜优良延展性和导热性，流求生产火炮只需要采用工艺简单的铸造法，而不需要川西霹雳军铁炮所采用的镗铣法工艺，生产出来的铜炮不仅重量轻而且性能也够用，更重要的是所花费工时短了许多。眼下流求铜料足够，只需进行精炼之后，便可大批量生产出舰用火炮。

海军的主战武器是船只，而船只的建造并非一朝一夕之事。一艘战船从选材、伐木、晾晒再到建造舾装、试航短则一年至两年，长则三至四年。如果有了已晾晒好的木料，也需要半年到一年的时间才能造出来。流求不管是当前的现实需要还是远期的威胁，都等不起这么长的时间，故余柱决定一方面派人收购造船木料，加大自行造船的力度，与此同时又派人多方重金购买船只进行改装，甚至还通过贿赂手段购买了沿海制置司水军的战船。“重赏之下必有勇夫”，只要价格给得足够高，水军那些官员敢冒着杀头的风险卖战船。这些买回来的战船在船坞进行改装之后，没有人会认出曾是官军战船。经过一番努力，流求购买改装了十余艘大中型船只和数十只小型船只，虽然仍未达廖泥鳅的预期，却也解决了当下的燃眉之急。