李仲文为首的唐军是李渊设立的阴平道都督府的军队，由于当时李渊一方面要防止汉川方向的隋军，另一方面又要防范自立的李世民，因此，他给了阴平道大都督窦轨三万兵力的配额，之后李世民又从成都派去三万名士兵，不过段元哲的一万大军全军覆没之后，李仲文现在的实际兵马是五万人。

也正是因为李仲文兵力众多，才时时刻刻威胁到杨侗大后方——普安郡、金山郡。所以不管杨侗要想保证粮道畅通，没有后顾之忧的征伐成都城，还是要把王雄诞、刘纲等部军队收拢，都必须先把李仲文这颗钉子连根拔起。

李仲文是西魏八柱国之一赵国公李弼的嫡孙，也是李密的堂叔，同时还是李氏家族家主，他和一起长大的李渊互称兄弟、关系极为密切。

作为全力支持李渊起兵的关陇贵族之一，李仲文也利用家族庄丁在关中建立了一支军队，并跟随李秀宁起兵于京兆郡鄠县，在关中给时为西京留守的杨侑造成巨大的麻烦，牵制了关中大部分隋军，有力的策应了李渊在并州的军事行动，李渊入主关中之后投桃报李，封他为太常少卿，后来出任行军总管，带兵坐镇并州，后来因为裴寂瞎指挥，破坏了李神符一切合理的部署，导致并州在不到一个月的时间内陷入大隋之手，而李仲文也因此战败被俘。战后被李渊重金赎回，并授予骠骑大将军之职，将之拉拢到了自己的身边。

然而李仲文却没有丝毫感恩之心，反而对李渊颇有怨言，原因有很多，首先是李渊入主关中之后，立即对功勋赫赫的李秀宁翻脸，不但把她和李仲文、何潘仁、向善志、丘师利辛辛苦苦建立起来娘子军拆分吞并干净，还把李秀宁贬为潼关守将，最后更是和亲给了杨侗，身为李渊嫡女的李秀宁尚且落到这步凄惨的田地，她麾下大将自然也好不到哪里去，李仲文和丘师利、何潘仁、向善志也通通被李渊打发去看门了，使他们这些立下大功的将领失去了一切权利。

但这只是一种不满，并不是李仲文怨恨李渊的根本原因，而根本原因是李渊过河拆桥，血洗了关陇贵族，虽然李仲文的家族属于窦氏派系，侥幸逃过了清洗之劫难，但也使他的家族失去了九成土地、九成奴隶和八成财富。之后更是纵容李元吉以各种毫无理由的理由，除掉了李氏的许许多多枝叶，使他一家成为李氏硕果仅存一家，作为李氏家主，这一直是李仲文最大心病。

不过李渊是李唐王朝的皇帝，他心中再不满也不敢有丝毫异动，只能老老实实的当着他的巴西郡太守，因为李渊虽然任命他为骠骑大将军，但同时也把他最后的军权收回，从而使他这个骠骑大将军没有丝毫权力。所以当窦轨派人与他联络，说是要支持李世民发动宫廷政变时，李仲文毫不犹豫的投降了李世民，将忠于李渊的郡丞许洛仁给宰了，之后获得了赵国公的爵位。

这次，李仲文得窦轨引荐，成了六万大军的主帅，也算是圆了他的统帅之梦，而段元哲也确确实实是他麾下大将，不过此人依仗自己是李世民嫡系将领，十分不服李仲文这位主帅，平时更是阳奉阴违，当李世民让他们主动进攻隋朝的命令抵达巴西郡，李仲文和段元哲在进军方向上出现了矛盾。